Белоглазая чернеть считается редкой водоплавающей птицей по нескольким причинам:

• Сокращение численности. 14 За последние несколько десятилетий количество белоглазых нырков серьёзно снизилось. 1 Например, в бывшем Советском Союзе число птиц сократилось с 140 000 пар в 1970 году до 5200 за 15 лет. 1
• Деградация среды обитания. 1 Белоглазые нырки предпочитают периметры водно-болотных угодий и небольшие неглубокие пруды, где гнездились. 1 Эти районы были сильно осушены, отлиты и переоборудованы. 1
• Неконтролируемая охота. 4 Большое количество белоглазых нырков убито охотниками, так как в полёте их трудно отличить от других нырков. 4

Для защиты вида белоглазая чернеть занесена в Международную Красную Книгу, а также в Красные Книги Российской Федерации, Украины и Казахстана. 1