Бактериородопсин важен для галофильных архей, потому что он играет роль протонного насоса. 1 Белок улавливает световую энергию и использует её для перемещения протонов через мембрану из клетки. 2 Полученный протонный градиент впоследствии преобразуется в химическую энергию. 2

На свету в молекуле бактериородопсина происходят конформационные изменения, сопровождающиеся изменением концентрации протонов Н+ по обе стороны клеточной мембраны. 1 Создаётся протонный градиент между наружной и внутренней её сторонами (концентрация Н+ снаружи выше, чем внутри клетки), что ведёт к возникновению электрохимического потенциала и выделению энергии, запасающейся в молекулах АТФ. 1

Таким образом, бактериородопсин позволяет галобактериальной клетке находить оптимальные условия для роста в среде с высокой солевой концентрацией и использовать свет как единственный неисчерпаемый источник энергии при дефиците других. 5