Археи считаются промежуточным звеном между доядерными и ядерными организмами, потому что они имеют черты как доядерных, так и ядерных организмов. 13

С одной стороны, археи — одноклеточные микроорганизмы, не имеющие ядра и каких-либо мембранных органелл, то есть относятся к доядерным организмам. 1 С другой стороны, некоторые гены и метаболические пути архей сближают их с эукариотами — доменом живых организмов, клетки которых содержат ядро. 1 Например, к таким генам относятся ферменты, катализирующие процессы транскрипции и трансляции. 1

Также есть предположение, что эукариоты — это результат симбиоза археи, игравшей роль клетки-хозяина, и бактерии, что дала начало митохондриям. 3