Архебактерии считаются важной группой в биотехнологиях и экологии по нескольким причинам:

В биотехнологиях архебактерии важны благодаря следующим свойствам:

• Адаптация к экстремальным условиям. 2 Архебактерии могут существовать в местах, которые непригодны для большинства других организмов: горячих источниках, кислых озёрах, глубоководных гидротермальных источниках. 2 Это позволяет использовать их как источник ферментов, которые работают в таких суровых условиях. 13 Например, ферменты архебактерий применяются в производстве продуктов питания при высоких температурах. 13
• Производство ферментов и белков. 2 Некоторые архебактерии продуцируют ферменты и белки с уникальными свойствами, которые ценны для промышленных процессов, таких как репликация ДНК, ПЦР (полимеразная цепная реакция) и белковая инженерия. 2
• Биоремедиация. 2 Определённые виды архебактерий способны разлагать загрязняющие вещества и токсины, что позволяет использовать их для очистки окружающей среды. 2

В экологии архебактерии важны по следующим причинам:

• Участие в круговороте веществ. 13 Архебактерии играют роль в круговоротах углерода и азота. 13 Они осуществляют многие этапы круговорота азота, включая реакции, удаляющие азот из экосистемы, и процессы, в ходе которых азот поглощается. 13
• Роль в симбиозе. 2 Архебактерии вступают в симбиотические отношения с другими организмами, например, метаногены в кишечнике жвачных животных, которые способствуют пищеварению. 2
• Переработка органических отходов. 4 Благодаря деятельности метаногенных архебактерий происходит практически полная переработка органических отходов, образуется перегной без опасных патогенов, плодородный и полезный для растений. 4