Апатит часто путают с другими минералами из-за его гексагональной структуры и разнообразных цветов. 1

Например, по неопытности апатит можно спутать с бериллом, так как он также имеет призматическую форму, а иногда даже с корундом, хотя от обоих минералов он значительно отличается по твёрдости. 4