Анализирующее скрещивание имеет важное значение в селекции животных, потому что с его помощью можно определить чистопородность особи. 1

Если доминантный признак является экономически значимым и определяет продуктивность или иную ценность животных, раннее определение гомозиготности помогает предотвратить финансовые потери. 1

Кроме того, анализирующее скрещивание является предварительным этапом при использовании промышленного скрещивания. 2 Его цель — получить финальных помесей, проявляющих эффект гетерозиса по одному или ряду селекционных признаков. 2

Например, в свиноводстве в качестве исходных пород используются матки крупной белой породы, которых спаривают с хряками породы дюрок для получения потомства с ярко выраженным проявлением эффекта гетерозиса по признакам многоплодия. 2