Анаэробное дыхание неэффективно с точки зрения энергообразования, потому что при нём отсутствуют цикл лимонной кислоты и перенос электронов, которые необходимы для полного окисления глюкозы. 1 В результате при анаэробном дыхании глюкоза окисляется не полностью, в результате чего выделяется меньше энергии. 1

Кроме того, при анаэробном дыхании значительная часть энергии остаётся «запертой» в этаноле или молочной кислоте. 3