Амеба протей считается важным звеном в экосистеме водоёмов, потому что она играет роль в пищевой цепи. 1 Она поглощает бактерии, одноклеточные водоросли и мелких простейших, обогащая водоём веществами пищи и энергией. 23

Таким образом, присутствие амебы протей помогает поддерживать баланс и устойчивость экосистемы, а также содействует разложению органического вещества и циркуляции питательных веществ в природе. 1

Кроме того, амёба протей может быть источником питания разных рыб, обитающих в водоёмах. 4

Таким образом, её роль заключается в том, что она регулирует численность и деятельность других микроорганизмов, что важно для общей экосистемы водоёмов.