Альтернативные признаки важны для понимания генетических закономерностей, потому что они отражают контрастные, взаимоисключающие проявления признака. 2 Например, белая и пурпурная окраска цветов, жёлтая и зелёная окраска семян, гладкая и морщинистая поверхность семян, карие и голубые глаза. 1

При изучении закономерностей наследования обычно скрещивают особи, отличающиеся друг от друга альтернативными признаками, что позволяет установить количественные закономерности в передаче изучаемых признаков. 4 Так, математическая обработка опытных данных позволила Грегору Менделю установить количественные закономерности в передаче изучаемых признаков. 4

Кроме того, благодаря альтернативным генам в генотипе обеспечивается генный баланс: они напрямую связаны с разнообразием, но не влияют на общее число хромосом и не касаются генома. 3