Почему алгоритм BLAST считается более эффективным для крупномасштабного поиска последовательностей?

Алгоритм BLAST считается эффективным для крупномасштабного поиска последовательностей, потому что он ориентирован на локальное выравнивание. static.igem.org

В отличие от глобального выравнивания, при котором последовательности сравниваются полностью, BLAST ищет подобие только в пределах некоторой части последовательности. static.igem.org Это связано с наличием в различных белках сходных доменов и паттернов. ru.wikipedia.org

Кроме того, BLAST фильтрует области с низкой сложностью в последовательности запроса. en.wikipedia.org Такие области могут давать высокие баллы, которые затрудняют поиск программой реальных значимых последовательностей в базе данных. en.wikipedia.org

Таким образом, BLAST обеспечивает баланс между скоростью поиска и вероятностью пропуска статистически значимых совпадений. www.researchgate.net