Агроценозы не могут поддерживать нормальное биоразнообразие экосистем по нескольким причинам:

• Сниженное видовое разнообразие. 12 На полях обычно культивируют один или несколько видов растений, что приводит к значительному обеднению видового состава животных, грибов, бактерий. 1
• Искусственный отбор. 12 В природных экосистемах существует естественный отбор, отвергающий неконкурентоспособные виды и формы организмов, что обеспечивает устойчивость системы. 1 В агроценозах действует преимущественно искусственный отбор, направленный на максимальное повышение урожайности сельскохозяйственных культур. 1
• Нарушение круговорота веществ. 25 В природном биогеоценозе происходит замкнутый круговорот веществ, а из агроценозов человек регулярно изымает часть вещества в виде сельскохозяйственной продукции. 2 Это приводит к необходимости вносить удобрения для компенсации забранных веществ. 2
• Отсутствие устойчивости. 4 Агроценозы не способны к саморегуляции и самовозобновлению, подвержены угрозе гибели при массовом размножении вредителей или возбудителей болезней. 1

Без участия человека агроценозы зерновых и овощных культур существуют не более года, многолетних трав — 3–4 года, плодовых культур — 20–30 лет. 1 Затем они распадаются или отмирают. 1