Когда устанавливают, что два каких-то гена возникли в результате дупликации, используют ли в качестве доказательства ... далее в комментарии?

Да, для доказательства того, что два гена возникли в результате дупликации, используют различные методы. en.wikipedia.org blogs.genotek.ru

Например, геномные микрочипы позволяют высокопроизводительное обнаружение хромосомных аномалий, в том числе микродупликаций, на основе образцов геномной ДНК. en.wikipedia.org Технология ДНК-микрочипов позволяет одновременно отслеживать уровни экспрессии тысяч генов при различных методах лечения или экспериментальных условиях. en.wikipedia.org

Секвенирование следующего поколения также помогает идентифицировать дупликации генов. en.wikipedia.org Самым простым способом выявления дубликатов в данных геномного повторного секвенирования является использование считываний с парных концов при секвенировании. en.wikipedia.org Тандемные дупликации обозначаются парами считанных секвенирований, которые отображаются в ненормальных ориентациях. en.wikipedia.org

Согласно базовой модели, появившиеся в результате дупликации два сестринских аллеля будут равноудалены от предкового гена и оба будут ортологами недуплицированных генов других групп. sciencejournals.ru