Суперкомпьютеры сыграли важную роль в области криптоанализа, так как позволили решать задачи, связанные с взломом криптоалгоритмов и криптопротоколов. 4

Некоторые задачи криптоанализа подразумевают применение метода «грубой силы» — перебора всех возможных вариантов. 25 Суперкомпьютеры облегчили этот процесс, так как могли работать с большими и сверхбольшими массивами данных. 23

Кроме того, суперкомпьютеры использовали для оценки криптографической стойкости современных алгоритмов шифрования. 23 Также их применяли для обучения специалистов в области информационной безопасности. 23

Например, во время Второй мировой войны одной из целей создания компьютера Colossus в Блетчли-парке был именно криптоанализ. 5 После войны некоторые компьютеры проектировались с учётом требований криптоаналитических служб, например, Cray-1 для АНБ США. 5