Роль рестриктаз в защите бактериального генома от посторонней ДНК заключается в разрушении попавшей в клетку чужеродной ДНК, например, бактериофагов и плазмид. 5
Рестриктазы разрезают молекулу ДНК в строго определённых участках, длиной от четырёх до семи пар нуклеотидов, при этом они расщепляют участок узнавания внутри или вне его. 1
Бактерия способна отличить свою собственную ДНК от любой вторгающейся «чужеродной» именно по типу её модификации. 2 Различие в модификации делает чужеродную ДНК чувствительной к действию рестрицирующих ферментов, которые узнают отсутствие метильных групп в соответствующих сайтах. 2
Аналогичные участки собственного генома бактерии защищены от эндонуклеаз при помощи метилирования, за которое отвечает фермент ДНК-метилтрансфераза. 4