Роль промоторов в процессе транскрипции заключается в том, что они служат стартовой площадкой для начала транскрипции. 5

Фермент РНК-полимераза узнаёт особый участок молекулы ДНК — промотор и связывается с ним. 2 После связывания с промотором происходит раскручивание молекулы ДНК, состоящей из двух цепей: транскрибируемой и смысловой. 2 В процессе транскрипции принимает участие только транскрибируемая цепь ДНК. 2

Также промотор позволяет РНК-полимеразе начать транскрипцию в правильном направлении и указывает на то, какая из двух цепей ДНК будет служить матрицей для синтеза РНК. 5

То, под каким промотором находится кодирующий РНК участок ДНК, играет решающую роль в интенсивности экспрессии этого гена в каждом конкретном типе клеток. 5