Роль миксотрофов в экосистеме заключается в следующем:

• Поддержание баланса в пищевых цепях. 2 Миксотрофы влияют на пищевые цепочки, взаимодействуют с другими организмами и участвуют в создании устойчивых сообществ. 2
• Смягчение последствий морских тепловых волн. 1 В океанических экосистемах миксотрофы помогают сгладить разделение воды на отдельные слои, что мешает смешению нутриентов, которые обычно подпитывают устойчивые морские экосистемы. 1
• Обеспечение выживания пищевых цепочек в периоды недостатка питательных веществ. 1 Смешанная стратегия миксотрофов, поглощение окружающей пищи подобно животному и вырабатывание собственной энергии подобно растениям, делает их более эффективными в такие времена. 1 Это означает, что пищевые цепочки, находящиеся на грани краха от недостатка питательных веществ, могут продолжать существование в присутствии миксотрофов дольше, чем без них. 1