Роль лизосом в процессе аутофагии заключается в том, что они поглощают и переваривают внутри себя собственные ненужные клетке структуры. 1
Сначала эти структуры окружаются одинарной мембраной, а затем мембранный мешочек с заключённой в нём структурой сливается с лизосомой, образуя так называемую автофагическую вакуоль, в которой структура переваривается. 1
После слияния с аутофагосомой кислые гидролазы в лизосоме расщепляют аутофагосомный груз, и далее питательные вещества высвобождаются обратно в цитоплазму для повторного использования клеткой. 3 Деградация клеточного материала в лизосоме является финальной стадией аутофагии. 3