Энхансеры играют важную роль в развитии и функционировании клеток, так как они регулируют активность генов. 13

Некоторые функции энхансеров:

• Задают временной и пространственный паттерн активности генов. 1 Энхансеры позволяют использовать один и тот же ген в различных процессах в пространстве и времени. 2
• Обеспечивают экспрессию гена на необходимом уровне в нужное время и в нужном месте в многоклеточном организме. 5
• Осуществляют тонкую дифференцированную регуляцию активности гена в процессе развития организма, при функционировании гена в клетках разного типа, при ответе организма на возникающие в нём или поступающие извне сигналы. 3
• Нередко имеют тканевую специфичность — один и тот же ген активируется в разных типах клеток при посредстве разных энхансеров. 4

Таким образом, энхансеры выступают в роли гибких регуляторов на уровне многоклеточного организма, представляя собой набор тонко регулируемых переключателей. 5