Роль бокоплавов в экосистеме водоёмов заключается в следующем:

• Санитарная функция. 15 Бокоплавы поедают останки трупов животных, разлагающиеся растения, планктон, что помогает очищать воду, делая её чистой и прозрачной. 1
• Кормовая база. 23 Многие рыбы и птицы используют бокоплавов в пищу. 24
• Биоиндикация состояния водоёмов. 35 Благодаря своей чувствительности к загрязнению бокоплавы служат биоиндикаторами санитарного состояния водоёмов. 5
• Участие в миграции микроэлементов. 5 Бокоплавы способны аккумулировать в больших количествах такие элементы, как медь, стронций, алюминий, титан, хром, ванадий, кобальт, марганец, барий, цинк, что позволяет судить о содержании этих металлов в водоёмах. 35