Роль белков синаптонемного комплекса в процессе мейоза заключается в следующем:

• Объединение и удержание гомологичных хромосом. 1 Комплекс не только соединяет, но и удерживает их на расстоянии, необходимом для нормального прохождения рекомбинационных процессов. 1
• Оптимизация частоты рекомбинации. 4 Хромосомы соединяются с помощью синаптонемного комплекса на некоторое время, в течение которого между ними совершается обмен гомологичными участками ДНК — кроссинговер. 3
• Редукция числа хромосом. 23 В результате редукционного деления (мейоза I) число хромосом в дочерних клетках уменьшается в два раза по сравнению с набором хромосом родительской клетки. 3