Бактерии играют важную роль в образовании природных залежей углеводородов. 13
В процессе биосинтеза нефти углекислые или сульфидные термальные растворы, двигаясь по разломам земной коры, провоцируют рост и размножение метановых и сернистых бактерий. 1 Они формируют первичные резервуары, состоящие из культур бактерий и продуктов их жизнедеятельности. 1 При достижении осадочного чехла платформ гидротермальная архебактериальная микрофлора и продукты её метаболизма (составляющие протонефть) постепенно отделяются от гидротермального флюида и скапливаются в ловушках, образуя залежи, в которых происходит окончательное созревание нефти. 1
Также бактерии участвуют в преобразовании твёрдых горючих ископаемых. 2 Они разукрупняют молекулы твёрдых ископаемых, разрывая углерод-углеродные и гетероатомные связи. 2 В результате происходит образование различных одноядерных ароматических соединений, нафтеновых и жидких парафиновых углеводородов, образующих различные нефтяные фракции. 2