Аквапорины играют роль «водных каналов», избирательно пропуская молекулы воды в клетку и из неё. 12 Они позволяют воде проходить через жировой слой клеточной мембраны, в то же время препятствуя протоку ионов и других растворимых веществ. 14
Некоторые аквапорины могут транспортировать не только воду, но и другие небольшие незаряженные молекулы, например глицерин и мочевину. 25
Аквапорины важны для разных процессов, в том числе: