Аммониты участвовали в формировании сложных экосистемных связей древних сообществ и играли важную роль в мезозойских экосистемах. 4 Некоторые аспекты их влияния:

• Участие в пищевых цепях. 4 Многие распространённые виды аммонитов выступали как хищниками, так и добычей. 4
• Предоставление убежищ. 13 В мезозое на поверхности континентов раскинулись обширные мелководные моря, в илистом дне которых сложно было рыть норы и негде было прикрепиться. 3 Аммониты помогали донным обитателям, предоставляя им надёжные укрытия. 13
• Субстрат для прикрепляющихся организмов. 23 Раковины аммонитов служили субстратом для многочисленных прикрепляющихся организмов, таких как двустворчатые моллюски и черви-серпулиды. 23
• Роль в эволюции других животных. 1 Например, палеонтологи предполагают, что начальные этапы эволюции раков-отшельников, возникших в мезозое, были связаны именно с раковинами аммонитов. 1

Аммониты столь часто встречались в мезозойских морях, а их окаменелости в таком изобилии попадаются в горных породах той эпохи, что они сыграли важную роль в разработке системы идентификации всех морских отложений мезозойской эры. 5