Роль мезоглеи в жизни морских животных заключается в том, что она служит внутренним скелетом, поддерживающим тело. 1 Её эластичные свойства помогают восстановить форму после деформации в результате сокращения мышц. 1

Кроме того, мезоглея содержит блуждающие амебоциты, которые играют роль в фагоцитозировании мусора и бактерий. 1 Эти клетки также борются с инфекциями, вырабатывая антибактериальные химические вещества. 1

Особенно хорошо развита мезоглея у планктонных форм — гребневиков и медуз, у которых она выполняет роль упругого скелета. 45 У коралловых полипов мезоглея может быть довольно обширной и содержать многочисленные мышечные волокна, а также минеральный или органический скелет и выделяющие его клетки. 45