Роль кэпирования в процессе транскрипции заключается в следующем:

• Инициация трансляции. 13 Благодаря кэпу начальный участок иРНК прикрепляется к рибосоме. 1
• Защита транскрипта от разрушительного действия рибонуклеаз. 1 Присутствие кэпа на 5'-конце защищает молекулы мРНК от быстрой деградации. 5
• Участие в сплайсинге. 1 Наличие кэпа необходимо для работы сплайсосомы, обеспечивающей удаление интронов. 3

Также кэпирование способствует эффективному процессингу пре-мРНК, экспорту мРНК из ядра и её трансляции. 5