Кэп играет важную роль в процессе образования зрелой мРНК, выполняя несколько функций: 13

• Инициация трансляции. 5 Благодаря кэпу начальный участок мРНК прикрепляется к рибосоме. 5
• Защита от деградации. 13 Присутствие кэпа на 5'-конце защищает молекулы мРНК от быстрой деградации под действием экзонуклеаз. 13
• Участие в сплайсинге. 35 В ряде случаев кэп инициирует сплайсинг интрона, прилегающего к 5'-концу. 4
• Регуляция транспорта РНК. 3 Кэп регулирует транспорт РНК между ядром и цитоплазмой. 3

Таким образом, кэп способствует эффективному процессингу пре-мРНК, экспорту мРНК из ядра и её трансляции. 13