Майкл Андерсон внёс следующий вклад в освоение космоса:

• Первый полёт 22–31 января 1998 года в составе экспедиции «Индевор STS-89». 3 В ходе полёта была осуществлена восьмая стыковка со станцией «Мир», доставка и возвращение грузов в модуль «Spacehab». 3 Также были проведены совместные исследования и эксперименты с экипажем станции и замена американского члена экипажа. 3
• Второй полёт 16 января — 1 февраля 2003 года в составе экспедиции «Колумбия STS-107». 3 Миссия была посвящена экспериментам, в рамках которых на орбите провели около 80 исследований, например, изучали рак простаты и влияние гравитации на муравьёв. 4 Как командир полезной нагрузки миссии, Майкл Андерсон отвечал за управление экспериментами и обеспечение их правильного выполнения. 4

Кроме того, в честь Майкла Андерсона в 2006 году Международный астрономический союз присвоил имя кратеру на обратной стороне Луны. 12