Различия между разговорным вариантом «скорей всего» и литературным «скорее всего» заключаются в их значении и употреблении:

• «Скорей всего» — это разговорное сочетание, которое выражает почти полную уверенность в чём-либо. 1 Оно допустимо в неформальной обстановке. 3
• «Скорее всего» — это литературное вводное словосочетание, использующееся в значении «вероятно», «по всей видимости». 23 Оно соответствует нормам современного русского языка и подходит для любых ситуаций, включая официальные. 3

Таким образом, «скорей всего» используется в разговорной речи, а «скорее всего» — в литературной, в том числе в формальной обстановке. 3 Выбор между этими вариантами зависит от контекста общения и от того, какое впечатление хочется произвести на собеседника. 3