Каковы преимущества и недостатки различных методов детекции амплифицированной ДНК?

Некоторые методы детекции амплифицированной ДНК и их особенности:

• Электрофорез. mibio.ru cyberleninka.ru Результат считается положительным при выявлении фрагмента ДНК, соответствующего по своей молекулярной массе ампликону контрольного образца. mibio.ru Недостатки: субъективность оценки результатов, низкая производительность, невозможность автоматизации процесса, трудность количественной оценки продуктов ПЦР. mibio.ru
• ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ). mibio.ru Процессы амплификации и детекции происходят одновременно в одной пробирке. mibio.ru Это практически полностью исключает загрязнение ампликонами рабочих помещений и сводит риск получения ложноположительных результатов к минимуму. mibio.ru Преимущество: количественная оценка числа копий ДНК целевого микроорганизма в исследуемом материале. mibio.ru Недостаток: для реализации этого метода необходимы сложные устройства. mibio.ru
• Петлевая изотермическая амплификация (LAMP). iairas.ru cyberleninka.ru К преимуществам относятся простота, скорость, специфичность и чувствительность, экономическая эффективность, высокая производительность. iairas.ru Недостаток: использование косвенных методов детектирования, которые не могут различать целевые продукты и продукты неспецифической амплификации, что часто приводит к ложноположительным результатам. iairas.ru
• Хеликазозависимая амплификация (HDA). microbiol.crie.ru Достоинства: быстрый и чувствительный метод амплификации нуклеиновой кислоты конкретной мишени при изотермической температуре, который не требует термоциклера. microbiol.crie.ru Недостатки: максимальный размер амплифицируемого фрагмента не превышает 120 п. н., необходимость оптимизации праймеров, а иногда и буферов. microbiol.crie.ru