Некоторые методы детекции амплифицированной ДНК и их особенности:

• Электрофорез. 15 Результат считается положительным при выявлении фрагмента ДНК, соответствующего по своей молекулярной массе ампликону контрольного образца. 1 Недостатки: субъективность оценки результатов, низкая производительность, невозможность автоматизации процесса, трудность количественной оценки продуктов ПЦР. 1
• ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ). 1 Процессы амплификации и детекции происходят одновременно в одной пробирке. 1 Это практически полностью исключает загрязнение ампликонами рабочих помещений и сводит риск получения ложноположительных результатов к минимуму. 1 Преимущество: количественная оценка числа копий ДНК целевого микроорганизма в исследуемом материале. 1 Недостаток: для реализации этого метода необходимы сложные устройства. 1
• Петлевая изотермическая амплификация (LAMP). 25 К преимуществам относятся простота, скорость, специфичность и чувствительность, экономическая эффективность, высокая производительность. 2 Недостаток: использование косвенных методов детектирования, которые не могут различать целевые продукты и продукты неспецифической амплификации, что часто приводит к ложноположительным результатам. 2
• Хеликазозависимая амплификация (HDA). 4 Достоинства: быстрый и чувствительный метод амплификации нуклеиновой кислоты конкретной мишени при изотермической температуре, который не требует термоциклера. 4 Недостатки: максимальный размер амплифицируемого фрагмента не превышает 120 п. н., необходимость оптимизации праймеров, а иногда и буферов. 4