Преимущества и недостатки различных видов микрофотографических систем:

1. Оптическая микрофотография. 2 Преимущества: возможность рассматривать живые клетки, цветное изображение, относительная несложность подготовки препарата, сравнительно дешёвый метод. 6 Недостаток: ограниченные возможности — можно увидеть лишь относительно крупные объекты в клетке: клеточные стенки, вакуоли, ядро, не всегда — митохондрии и пластиды. 6
2. Электронная микроскопия. 39 Преимущества: возможность увидеть строение всех органоидов клетки, например внутреннее строение хлоропластов и митохондрий, рибосом, центриолей и микротрубочек. 6 Недостатки: готовить образцы для исследования сложно и долго, живые объекты увидеть не получится, так как препараты специальным образом обрабатывают, изображения чёрно-белые, электронный микроскоп дорого стоит, необходимо обладать специальными навыками для работы с ним. 6
3. Цифровая микрофотография. 24 Преимущества: оперативность получения снимков, лёгкость дальнейшей цифровой постобработки изображения, например, недостаточная глубина резкости легко может быть исправлена за счёт применения специализированного программного обеспечения. 24
4. Сканирующий зондовый микроскоп. 15 Преимущества: возможность получать изображение как проводящей, так и непроводящей поверхности, изучать материалы и биологические объекты в нормальных для этих объектов условиях, например, биомакромолекул и их взаимодействий, живых клеток. 15 Недостатки: небольшой размер поля сканирования, качество изображения определяется радиусом кривизны кончика зонда, что при неправильном выборе зонда или его повреждении приводит к появлению артефактов на получаемом изображении. 15