Некоторые преимущества метода клеточной селекции in vitro:

• возможность работать с большими выборками генотипов в лабораторных условиях; 13
• доступный контроль окружающей среды; 1
• экономия места и материальных затрат; 1
• быстрый скрининг материала; 1
• возможность тестировать единичные клетки или небольшие участки тканей вне растительного организма; 1
• создание генетических комбинаций, усиление или уменьшение того или иного признака, а затем их отбор и передача регенерантам; 1
• формирование устойчивости культур одновременно к нескольким стресс-факторам. 1

Некоторые недостатки метода клеточной селекции in vitro:

• трудности в нахождении приемлемого для отбора маркера из-за сложности механизмов генетической детерминации селективных признаков; 1
• сложность селекции тех признаков, которые проявляются на уровне клеточных связей и полноценного растения; 1
• низкий уровень получения регенерантов из клеточных культур; 1
• часто нарушена корреляция селективного признака между культурой и интактным растением; 1
• нестабильность проявления эпигенетических изменений в культивируемых клетках; 1
• часто признаки, выгодные в хозяйственно-экономическом отношении, сцеплены с нежелательными; 1
• влияние селективных агентов тесно зависит от фазы развития клеточной популяции; 1
• возможность генетической нестабильности и нежелательные мутации генома в культуре; 1
• отсутствие естественной среды провоцирует риски, связанные с непредвиденным проявлением культуры в полевых условиях. 1