Взаимоотношения гриба и водоросли в теле лишайника основаны на симбиозе. 15 Грибы создают среду для жизни водорослей, удерживая влагу и обеспечивая субстрат для роста. 5 Водоросли, в свою очередь, в результате фотосинтеза производят углеводы, которые потребляют грибы. 5

Гриб создаёт водоросли более благоприятный микроклимат: защищает её от высыхания, экранирует от ультрафиолетового излучения, обеспечивает жизнь на кислых субстратах, смягчает действие ряда других неблагоприятных факторов. 2

Однако взаимоотношения нельзя называть постоянными. 3 При недостатке питательных веществ гриб начинает паразитировать на водоросли, что иногда приводит к гибели последней. 3

Также учёные считают, что водорослевый и грибной компоненты лишайника находятся в сложных взаимоотношениях: микобионт ведёт себя как паразит и сапрофит на теле водоросли, а фикобионт, в свою очередь, паразитирует на лишайниковом грибе. 4