Основные угрозы для популяции пустынной дождевой лягушки:

• Потеря среды обитания. 1 Индустриализация, жилищное строительство и добыча полезных ископаемых в регионе обитания лягушек приводят к сокращению их популяции и вынуждают сужать среду. 1
• Загрязнение. 1 Сток, урбанизация и фрагментация среды обитания также влияют на численность вида. 1

Кроме того, на глобальную популяцию земноводных в целом влияют изменения климата. 2 Из-за высокой температуры животные быстро обезвоживаются и теряют места размножения из-за засух. 2 А более частые, интенсивные и продолжительные штормы, наводнения и повышение уровня моря могут разрушить среду обитания амфибий. 2