Основные угрозы для популяции комодского варана в дикой природе:

• Туризм. 5 Неконтролируемый поток посетителей нарушает естественную среду обитания варанов, пугает их и приводит к уменьшению численности их добычи. 5
• Заселение территории. 5 Расширение населённых пунктов и строительство инфраструктуры приводит к уменьшению площади естественной среды обитания варанов. 5
• Истребление привычной для варанов добычи. 5 Охота на диких животных, таких как олени, свиньи и буйволы, которые являются основным источником пищи для варанов, уменьшает их продовольственную базу. 5
• Природные катаклизмы. 1 Землетрясения, цунами, извержения вулканов делают традиционные территории обитания варанов непригодными для жизни. 1