Некоторые основные различия между археями и эубактериями:

• Клеточная структура. 1 Археи обладают уникальными клеточными мембранами, которые состоят из разветвлённых углеводородных цепей, прикреплённых к глицерину эфирными связями. 1 Эти мембраны более устойчивы к экстремальным условиям, в то время как клеточные мембраны эубактерий состоят из прямых углеводородных цепей, присоединённых к глицерину сложноэфирными связями. 1
• Метаболизм и источники энергии. 1 Археи проявляют широкий спектр метаболических путей, включая фотосинтез, хемосинтез и ферментацию. 1 Эубактерии также обладают широким спектром метаболических возможностей: некоторые являются автотрофами, способными синтезировать свои органические молекулы из неорганических источников, в то время как другие — гетеротрофы, полагающиеся в своём питании на органические источники. 1
• Состав клеточной стенки. 1 Клеточные стенки археев состоят из различных уникальных молекул, таких как псевдомореин или клеточные стенки на основе белка. 1 Клеточные стенки эубактерий состоят из пептидогликана. 16