Основные преимущества рекомбинации в молекулярной биологии:

• Создание разнообразия комбинаций генов. 4 Это обеспечивает высокий уровень наследственной изменчивости, что позволяет популяции лучше адаптироваться в ходе эволюции. 4
• Репарация ДНК. 24 Рекомбинация — наиболее широко используемый клетками способ устранения двух- или однонитевых повреждений ДНК. 4
• Использование в генной инженерии. 2 Рекомбинация может применяться для удаления нежелательных мутаций, создания новых аллелей, вставки или слияния функциональных доменов. 2

Некоторые недостатки рекомбинации:

• Разрушение родительских комбинаций аллелей. 3 Вместо них возникают новые, ранее не опробованные комбинации, которые могут оказаться как хуже, так и лучше родительских. 3
• Разрушение комбинаций, специфичных для половых хромосом. 3 Например, если на Y-хромосоме есть аллели, определяющие «самцовость», то им лучше передаваться вместе. 3

Таким образом, преимущества рекомбинации заключаются в создании новых возможностей для эволюции и адаптации, а недостатки — в разрушении некоторых родительских комбинаций аллелей.