Основные функции и роль внехромосомной ДНК в клетках прокариот включают:

• Контроль процессов метаболизма. 1 Вспомогательные гены, локализованные в плазмидах, контролируют разные процессы метаболизма и морфофизиологические признаки, обеспечивающие приспособленность к определённой экологической нише. 1
• Перенос генетической информации. 14 Способность плазмид быстро копироваться и передаваться из клетки в клетку при внутривидовой, межвидовой и межродовой конъюгации бактерий определяет важную роль плазмид в эволюции этих организмов. 3
• Применение в экспериментах по генетической инженерии. 3 Плазмиды как автономные единицы репликации (репликоны) используют для получения в промышленных масштабах биологически активных белков — ферментов, гормона роста, инсулина и других. 3