Значение современных папоротникообразных заключается в следующем:

• В природе папоротникообразные участвуют во многих пищевых цепочках, в круговороте веществ, синтезируют кислород и углекислый газ. 2 Их большие листья препятствуют высыханию почвы, обеспечивая её количество для своего произрастания и для других растений и деревьев. 15
• В жизни человека некоторые виды папоротников используют в пищу (например, папоротник орляк). 23 Другие применяют в медицине (например, из корневищ щитовника мужского делают противоглистные препараты). 23 Также папоротники широко распространены как декоративные растения, их используют для украшения жилых помещений, в аквариумах и водоёмах. 3
• В сельском хозяйстве некоторые виды папоротников служат зелёными удобрениями, обогащая почву азотом (например, виды азоллы). 2
• В научных целях используются споры папоротников, например у плауна булавовидного. 1 Из них производят разные присыпки, в том числе детские. 1
• В ветеринарии папоротниковидные растения применяют для лечения некоторых заболеваний у животных. 1
• Из стеблей папоротников можно производить краску, которая годится для окрашивания тканей. 1