Происхождение многоклеточных организмов в ходе эволюции объясняется несколькими гипотезами:

1. Гипотеза гастреи Э. Геккеля. 3 Согласно ей, многоклеточные развились от колониальных жгутиковых. 3 По мнению учёного, вначале возникли одноклеточные амебообразные организмы (цитеи), а после из них развились колонии из нескольких особей (позже они превратились в шаровидные однослойные колонии — бластеи). 3 Двухслойный организм (гастрея) возник в результате выпячивания стенки бластеи внутрь (это называется инвагинацией). 3
2. Гипотеза плакулы А. Бючли. 3 По её мнению, многоклеточные происходят из двухслойной плоской колонии простейших (плакулы). 3 Функцию питания в этом случае выполнял слой плакулы, который был обращён к субстрату и поглощал пищевые частицы со дна. 3 В результате изгибания одной стороной вверх произошло превращение двухслойной плакулы в гастрееподобный организм. 3
3. Гипотеза билатерогастреи Т. Егерстена. 3 В основе этой теории лежит идея, что предком многоклеточных организмов была шарообразная колония растительных жгутиковых (схожая с вольвокс). 3
4. Гипотеза фагоцителлы И. И. Мечникова. 3 Согласно ей, поначалу временная дифференциация клеток превратилась в постоянную, что стало причиной преобразования колонии одноклеточных в многоклеточный организм. 3

Расцвет многоклеточных форм начался около 600 млн лет назад, однако появиться они могли и раньше, около 2 млрд лет назад. 1