Роль железобактерий в образовании природных минеральных месторождений заключается в том, что они окисляют растворимые в воде соединения двухвалентного железа в трёхвалентные нерастворимые. 1 Это приводит к формированию железных (болотных) руд и, таким образом, железобактерии являются концентраторами железа в природе. 1

Благодаря жизнедеятельности этих микроорганизмов на дне болот и морей образуется огромное количество руд железа и марганца. 5 Например, в результате их деятельности ферригидрит может самопроизвольно превратиться в гематит (красный железняк), а если он находится в растворе, содержащем Fe+2, — в гетит (бурый железняк), образующий богатые скопления легкоплавкой железной руды. 2