Роль сине-зелёных водорослей (цианобактерий) в экосистемах Земли заключается в следующем:

• Создание современной кислородсодержащей атмосферы. 12 Цианобактерии были первой жизненной формой, которая развила фотосинтез и начала насыщать атмосферу Земли кислородом около 2,43 миллиарда лет назад. 5
• Начало большей части пищевых цепей. 1 Являясь значительной составляющей океанического планктона, цианобактерии стоят в начале большей части пищевых цепей и производят значительную часть кислорода (вклад точно не определён: наиболее вероятные оценки колеблются от 20% до 40%). 1
• Вклад в глобальные потоки углерода и азота. 4 Планктонные цианобактерии являются фундаментальным компонентом морских пищевых сетей и вносят основной вклад в глобальные потоки углерода и азота. 4
• Освоение незаселённых участков суши. 1 Сине-зелёные водоросли являются «пионерами природы», то есть первыми осваивают незаселённые участки суши. 1 Наличие органического вещества позволяет существовать в таких сообществах и простейшим животным организмам. 1