Роль лизосом в клеточном пищеварении заключается в внутриклеточном расщеплении и переваривании веществ, поступивших в клетку или находящихся в ней, и удалении из клетки. 3 Лизосомальные ферменты обеспечивают переваривание веществ, попадающих в клетку в процессе эндоцитоза, а также нейтрализацию питательных соединений и чужеродных агентов. 1

Роль лизосом в аутофагоцитозе заключается в расщеплении ненужных клетке клеточных структур, которые осуществили свою функцию и должны покинуть клетку. 1 Например, во время замены старых органоидов новыми или при переваривании белков и других веществ, произведённых внутри самой клетки. 4 После переваривания захваченный материал попадает в цитоплазму, а непереваренные остатки пищи остаются на месте и формируют остаточное тельце. 1