Роль ланцетников в экосистеме морских вод заключается в том, что они фильтруют воду, очищая её от взвешенных пищевых частиц органического происхождения. 24 Таким образом они поддерживают качество воды и вносят вклад в круговорот питательных веществ. 1

Кроме того, ланцетники служат пищей для мелких морских обитателей, а в странах Юго-Восточной Азии они являются важными пищевыми продуктами и в рационе людей. 5

Также ланцетники представляют научный интерес как модельные объекты для исследований, так как являются одними из ближайших ныне живущих родственников позвоночных и дают ценную информацию о ранней эволюции и развитии хордовых. 1

Ещё ланцетники имеют практическое применение — в ряде стран их употребляют в пищу. 2