Роль инверсий в эволюции половых хромосом заключается в следующем:

• Увеличения нерекомбинирующей части Y-хромосомы. 13 Например, у млекопитающих эта часть является результатом серии инверсий, которые накладывались друг на друга. 2
• Объединения аллелей генов, определяющих пол. 13 Инверсия захватила два гена, один из которых определял пол, а второй обладал половым антагонизмом. 1 Инверсия объединила аллели этих двух генов таким образом, что аллель, определяющий мужской пол, оказался в устойчивой комбинации с повышающим мужскую приспособленность аллелем второго гена. 1
• Образования новых половых хромосом. 2 Инверсии могут вызвать нарушение равновесия связи между мутацией, определяющей пол, и локусами-антагонистами пола и создать новую половую хромосому из аутосомы. 2