Роль аппарата Гольджи в обработке и транспортировке белков в клетке заключается в следующем:

1. Сбор и отправка белковых продуктов. 2 Белки, синтезируемые в эндоплазматическом ретикулуме, переносятся в аппарат Гольджи внутри везикул и сливаются с его мембранами. 2
2. Модификация белков. 12 В цистернах аппарата Гольджи созревают белки, предназначенные для секреции, трансмембранные белки плазматической мембраны, белки лизосом и т. д.. 2 Созревающие белки последовательно перемещаются по цистернам в органеллы, где происходят их модификации — гликозилирование и фосфорилирование. 2
3. Сортировка белков. 12 В аппарате Гольджи белки сортируются, получают «метку», направляются в один из трёх «потоков» и доставляются к конкретному «адресу». 1
4. Направление белков к месту назначения. 2 После обработки аппаратом Гольджи белки в везикулах направляются к месту назначения внутри клетки или выделяются во внешнюю среду посредством экзоцитоза. 2