Роль аммония в биохимических процессах живых организмов заключается в следующем:

• Азотфиксация. 25 Азотфиксирующие бактерии способны утилизировать азот из атмосферного воздуха, восстанавливая его до аммония с помощью специального фермента (нитрогеназы). 5 Без аммония нельзя сделать ни белки, ни нуклеиновые кислоты. 2
• Ассимиляция аммиака. 5 Большинство бактерий усваивает аммоний в ходе этого процесса. 5 Бактерии, растущие на средах с аммонием, могут непосредственно включать его в органические соединения. 5
• Синтез аминокислот и других азотсодержащих компонентов клетки. 5 Аммоний используется для этого вместе с аммиаком, который образуется в результате ассимиляционной нитратредукции. 5

Кроме того, ион и аммиак — составные части биологического азотного круговорота, необходимого для функционирования экосистем. 1