Вакуоли играют важную роль в защите растений от вредителей и патогенов, выполняя несколько функций:

• Хранение ядовитых веществ. 5 В вакуолях растения могут накапливать токсичные соединения, которые не наносят вреда цитоплазме или каким-либо органеллам. 5 Например, у некоторых акаций в вакуолях содержатся цианиды. 5 Пока они остаются в целостных вакуолях, растению они не вредят. 5 Но если животное начнёт щипать листья растения, то цианид выделится из разорванных вакуолей и животное отравится. 5
• Защита клетки от микроорганизмов. 1 Вакуоли участвуют в защите клетки от вторгающихся микроорганизмов с помощью лизосом, которые борются с бактериями, вирусами и другими патогенами. 1
• Детоксикация. 2 Вакуоли изолируют вторичные продукты метаболизма и метаболические яды, в них происходят процессы детоксикации и катаболической деградации целого ряда соединений. 2
• Переработка отходов. 1 Вакуоли помогают в переработке расщеплённых белков, что способствует укреплению клеток и особенно важно для клеток растений. 1