Серобактерии имеют значение в металлургии и очистке воды:

• В металлургии некоторые серобактерии используют для выщелачивания металлов из руд. 5
• В очистке воды илы, содержащие серобактерии, применяют для очистки сточных вод от сероводорода (за счёт превращения его в сульфат). 12 Также серобактерии используют в технологиях биохимической очистки сероводородсодержащих вод, чтобы нейтрализовать токсичные сероводород и сульфиды, переводя их в безвредные сульфаты. 4

Однако у деятельности серобактерий есть и негативные стороны: в результате образования серной кислоты они могут быть причиной разрушения каменных и бетонных сооружений, коррозии металлического оборудования в шахтах и т. д.. 5