Некодирующие гены имеют следующее значение в регуляции активности генов:

• Влияние на регуляцию экспрессии генов и синтеза белков. 1 Некодирующая ДНК может выступать в роли энхансеров и сайленсеров для различных генов. 1
• Участие в процессинге мРНК. 5 Некодирующие элементы генов, входящие в состав 3'-концевых нетранслируемых областей мРНК, участвуют в процессинге мРНК, контролируют их стабильность и локализацию транскриптов в клетке, а также оказывают влияние на скорость трансляции. 5
• Воздействие на модификацию гистонов и целевое метилирование ДНК. 3 Длинные некодирующие (lncРНК) и малые некодирующие (нкРНК) РНК регулируют активность генов не только посттранскрипционно, но и путём воздействия на модификацию гистонов и целевое метилирование ДНК. 3
• Регуляция роста и пролиферации клеток, а также их дифференцировки. 2 Рибосомные гены, например, обеспечивают нормальное функционирование генома, контролируя процессы образования гетерохроматина и подавления экспрессии различных групп генов. 2