Находки аномалокариса имеют следующее значение для палеонтологии:

• Прояснили положение аномалокарисов в системе животного царства. 2 Большинство специалистов помещают их у основания эволюционного древа членистоногих, но не утверждают что-то определённое об их родстве с теми или иными группами настоящих членистоногих. 2
• Установили, что фасеточное зрение начало развиваться у членистоногих раньше, чем считалось до сих пор. 3 Наличие сложных глаз у аномалокариса позволяет утверждать, что каждый глаз содержал как минимум 16 тысяч гексагональных линз. 3
• Позволили уточнить расположение базальных ветвей на эволюционном древе членистоногих. 2 Например, находка в отложениях раннего девона переходной формы между среднекембрийскими хищниками аномалокарисами и настоящими членистоногими существенно прояснила родственные связи аномалокариса и взаимное расположение главных ветвей, расходящихся от основания эволюционного древа членистоногих. 2